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SNP检测

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  • 上海希匹吉生物技术有限公司

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  • 产品说明

    单核苷酸多态(SNP)是指有单个核苷酸替代、插入或缺失而形成的分子形态,有时括有多个核苷酸插入或缺失造成的点突变。通常情况下是一种2等位基因的变异,并多为转换,即嘧啶碱基之间的转换或嘌呤碱基之间的转换。SNP在CG序列上出现最为频繁,而且多是C-T,因为CG中的C常为甲基化的,自发脱落后变为T。SNP是人类基因组中数量最多的一种多态形式,人类基因组中总共有300万个SNP,平均每1000个碱基中就有一个SNP。SNP的分布不均匀,非转录区要多于转录区,大多数位于蛋白的非编码区。其中相当多的SNP位点直接或间接与个体间的表型差异、人类对疾病的易感性或抵抗能力有关。SNP检测在临床及临床相关研究中已有广泛应用。  

     

    本公司可以提供两种SNP检测方法:

    一. Taqman探针法:该方法的技术基础是实时荧光定量PCR。

       针对同一SNP位点的不同基因型设计两条不同的Taqman探针,把它们同时万博官方manbetx下载到PCR反应体系中,只有与靶序列完全匹配的探针才能被水解并释放出荧光信号。两条探针分别标记不同的荧光基团,分别用实时荧光定量PCR仪中对应的荧光检测通道检测荧光信号。某种基因型对应的荧光探针能够释放荧光信号,说明在原始DNA样本中含有该中基因型。如果只有一条探针能释放荧光信号,那么检测的SNP位点上是纯合子,如果两条探针都有荧光信号,那么在该SNP位点上是杂合子。(如图1)

      

      

      图1:Taqman探针法检测SNP位点技术原理

      

      图2a:纯合子的扩增曲线

      

      图2b:杂合子的扩增曲线

      这种方法可以直接在实验结果(软件自动输出的Excel表格)中读出每个样本中SNP的基因型(纯合子XX或YY,杂合子XY),不需要再对序列进行分析,具有直观性。

      并且还可以通过软件分析出不同基因型在所有样本中的分布图(如图3)。

      

      图3:SNP散点图

           Taqman探针法对于大样本量的检测还有成本低、速度快的优点。

    二. 焦磷酸测序(Pyrosequencing)法:该方法的技术原理基于焦磷酸测序技术,可以定量检测SNP位点的突变频率。


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